Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms