Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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