Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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Ttf1Q62187 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttf1Q62187 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf1Q62187 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf1Q62187 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf1Q62187 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf1Q62187 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf1Q62187 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf1Q62187 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf1Q62187 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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Ttf1Q62187 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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Ttf1Q62187 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf1Q62187 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf1Q62187 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf1Q62187 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf1Q62187 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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Ttf1Q62187 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttf1Q62187 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttf1Q62187 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttf1Q62187 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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Ttf1Q62187 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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Ttf1Q62187 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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Ttf1Q62187 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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Ttf1Q62187 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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Ttf1Q62187 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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Ttf1Q62187 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttf1Q62187 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Ttf1Q62187 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Ttf1Q62187 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Ttf1Q62187 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Ttf1Q62187 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttf1Q62187 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttf1Q62187 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttf1Q62187 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttf1Q62187 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttf1Q62187 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttf1Q62187 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttf1Q62187 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttf1Q62187 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttf1Q62187 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttf1Q62187 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttf1Q62187 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttf1Q62187 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttf1Q62187 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttf1Q62187 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttf1Q62187 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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