Protein–RNA interactions for Protein: Q61249

Igbp1, Immunoglobulin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igbp1Q61249 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Igbp1Q61249 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Igbp1Q61249 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Igbp1Q61249 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms