Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc27a1Q60714 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc27a1Q60714 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc27a1Q60714 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms