Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prdm1Q60636 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm1Q60636 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms