Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Sin3aQ60520 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sin3aQ60520 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms