Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf135Q5VTT2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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