Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CluhQ5SW19 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CluhQ5SW19 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CluhQ5SW19 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CluhQ5SW19 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CluhQ5SW19 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CluhQ5SW19 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CluhQ5SW19 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CluhQ5SW19 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CluhQ5SW19 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CluhQ5SW19 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CluhQ5SW19 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CluhQ5SW19 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CluhQ5SW19 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CluhQ5SW19 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CluhQ5SW19 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CluhQ5SW19 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CluhQ5SW19 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CluhQ5SW19 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CluhQ5SW19 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CluhQ5SW19 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CluhQ5SW19 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CluhQ5SW19 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CluhQ5SW19 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms