Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE3

Ccdc92b, Coiled-coil domain-containing 92B, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92bQ5SUE3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc92bQ5SUE3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.2 ms