Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms