Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC31.82■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Rapgef6Q5NCJ1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Rapgef6Q5NCJ1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms