Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trim58Q5NCC9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim58Q5NCC9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms