Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
1810065E05RikQ5NC41 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
1810065E05RikQ5NC41 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms