Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH67

Xkr4, XK-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xkr4Q5GH67 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xkr4Q5GH67 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xkr4Q5GH67 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xkr4Q5GH67 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xkr4Q5GH67 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xkr4Q5GH67 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xkr4Q5GH67 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xkr4Q5GH67 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xkr4Q5GH67 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xkr4Q5GH67 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xkr4Q5GH67 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xkr4Q5GH67 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xkr4Q5GH67 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xkr4Q5GH67 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xkr4Q5GH67 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xkr4Q5GH67 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xkr4Q5GH67 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xkr4Q5GH67 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xkr4Q5GH67 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xkr4Q5GH67 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xkr4Q5GH67 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xkr4Q5GH67 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms