Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rtl5Q5DTT4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms