Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL39P5Q59GN2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms