Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmtc2Q56A06 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmtc2Q56A06 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms