Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Spire1Q52KF3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms