Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syne3Q4FZC9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syne3Q4FZC9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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