Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Foxn3Q499D0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms