Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Esf1Q3V1V3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Esf1Q3V1V3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Esf1Q3V1V3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Esf1Q3V1V3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Esf1Q3V1V3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Esf1Q3V1V3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Esf1Q3V1V3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Esf1Q3V1V3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Esf1Q3V1V3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Esf1Q3V1V3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Esf1Q3V1V3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Esf1Q3V1V3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Esf1Q3V1V3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Esf1Q3V1V3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Esf1Q3V1V3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Esf1Q3V1V3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Esf1Q3V1V3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Esf1Q3V1V3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Esf1Q3V1V3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Esf1Q3V1V3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Esf1Q3V1V3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Esf1Q3V1V3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Esf1Q3V1V3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Esf1Q3V1V3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms