Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC051142Q3V0M8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC051142Q3V0M8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC051142Q3V0M8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms