Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rimbp3Q3V0F0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rimbp3Q3V0F0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rimbp3Q3V0F0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rimbp3Q3V0F0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rimbp3Q3V0F0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Rimbp3Q3V0F0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rimbp3Q3V0F0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rimbp3Q3V0F0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rimbp3Q3V0F0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Rimbp3Q3V0F0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Rimbp3Q3V0F0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Rimbp3Q3V0F0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Rimbp3Q3V0F0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rimbp3Q3V0F0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms