Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnpc3Q3UZ01 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnpc3Q3UZ01 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnpc3Q3UZ01 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnpc3Q3UZ01 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnpc3Q3UZ01 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnpc3Q3UZ01 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnpc3Q3UZ01 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnpc3Q3UZ01 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnpc3Q3UZ01 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnpc3Q3UZ01 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnpc3Q3UZ01 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnpc3Q3UZ01 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnpc3Q3UZ01 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnpc3Q3UZ01 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnpc3Q3UZ01 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnpc3Q3UZ01 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms