Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Prdm10Q3UTQ7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prdm10Q3UTQ7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm10Q3UTQ7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms