Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQU0

Brd9, Bromodomain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd9Q3UQU0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd9Q3UQU0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brd9Q3UQU0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms