Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrc4Q3UP24 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms