Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Rmdn3Q3UJU9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rmdn3Q3UJU9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Rmdn3Q3UJU9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Rmdn3Q3UJU9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Rmdn3Q3UJU9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Rmdn3Q3UJU9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Rmdn3Q3UJU9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
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Rmdn3Q3UJU9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Rmdn3Q3UJU9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.3 ms