Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI43

Babam1, BRISC and BRCA1-A complex member 1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Babam1Q3UI43 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Babam1Q3UI43 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Babam1Q3UI43 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms