Protein–RNA interactions for Protein: Q3U552

A930003A15Rik, RIKEN cDNA A930003A15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930003A15RikQ3U552 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms