Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy4Q3TYX8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms