Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 632 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Gdpd4Q3TT99 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Gdpd4Q3TT99 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Gdpd4Q3TT99 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gdpd4Q3TT99 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Gdpd4Q3TT99 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdpd4Q3TT99 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms