Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc10Q3TLI0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc10Q3TLI0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms