Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Zfp444Q3TDV8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Zfp444Q3TDV8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zfp444Q3TDV8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms