Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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