Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDRF1Q3B7T1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms