Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd11Q1RNF8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd11Q1RNF8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd11Q1RNF8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd11Q1RNF8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd11Q1RNF8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd11Q1RNF8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd11Q1RNF8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd11Q1RNF8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd11Q1RNF8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd11Q1RNF8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd11Q1RNF8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd11Q1RNF8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd11Q1RNF8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd11Q1RNF8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd11Q1RNF8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samd11Q1RNF8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samd11Q1RNF8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samd11Q1RNF8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samd11Q1RNF8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samd11Q1RNF8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd11Q1RNF8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd11Q1RNF8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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