Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FXNQ16595 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FXNQ16595 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FXNQ16595 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FXNQ16595 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FXNQ16595 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FXNQ16595 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FXNQ16595 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FXNQ16595 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FXNQ16595 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FXNQ16595 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FXNQ16595 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FXNQ16595 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FXNQ16595 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FXNQ16595 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FXNQ16595 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FXNQ16595 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FXNQ16595 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FXNQ16595 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FXNQ16595 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FXNQ16595 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FXNQ16595 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FXNQ16595 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FXNQ16595 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FXNQ16595 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FXNQ16595 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FXNQ16595 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FXNQ16595 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FXNQ16595 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FXNQ16595 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FXNQ16595 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FXNQ16595 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FXNQ16595 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FXNQ16595 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FXNQ16595 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FXNQ16595 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FXNQ16595 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXNQ16595 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXNQ16595 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FXNQ16595 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXNQ16595 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXNQ16595 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXNQ16595 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXNQ16595 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXNQ16595 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FXNQ16595 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXNQ16595 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXNQ16595 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FXNQ16595 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FXNQ16595 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FXNQ16595 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FXNQ16595 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FXNQ16595 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FXNQ16595 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FXNQ16595 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FXNQ16595 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FXNQ16595 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FXNQ16595 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FXNQ16595 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FXNQ16595 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FXNQ16595 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FXNQ16595 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.6 ms