Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFKBIBQ15653 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFKBIBQ15653 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms