Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
MADCAM1Q13477 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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