Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFIAQ12857 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
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