Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D2

FAM69C, Protein FAM69C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69CQ0P6D2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FAM69CQ0P6D2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FAM69CQ0P6D2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
FAM69CQ0P6D2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
FAM69CQ0P6D2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
FAM69CQ0P6D2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
FAM69CQ0P6D2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC36■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
FAM69CQ0P6D2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms