Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h18Q0P678 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zc3h18Q0P678 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms