Protein–RNA interactions for Protein: Q07478

SUB2, ATP-dependent RNA helicase SUB2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUB2Q07478 SPO11YHL022C 1197 nt7.21□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 EGD2YHR193C 525 nt7.21□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 OGG1YML060W 1131 nt7.21□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 KSH1YNL024C-A 219 nt7.21□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 OPI11YPR044C 354 nt7.21□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 SAS10YDL153C 1833 nt7.21□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 CEM1YER061C 1329 nt7.21□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 MPP10YJR002W 1782 nt7.2□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 HSM3YBR272C 1443 nt7.2□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 LUC7YDL087C 786 nt7.2□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 MSS2YDL107W 1056 nt7.2□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 CBS2YDR197W 1170 nt7.2□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YFL012WYFL012W 447 nt7.2□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 MTD1YKR080W 963 nt7.2□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 SPS18YNL204C 903 nt7.2□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 IZH4YOL101C 939 nt7.2□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YBR013CYBR013C 390 nt7.2□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 BSD2YBR290W 966 nt7.2□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 GIP1YBR045C 1920 nt7.2□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 NSI1YDR026C 1713 nt7.2□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 RBA50YDR527W 1320 nt7.2□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 TOS2YGR221C 1869 nt7.19□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 GAS5YOL030W 1455 nt7.19□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt7.19□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 RAD59YDL059C 717 nt7.19□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YDL218WYDL218W 954 nt7.19□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YGR015CYGR015C 987 nt7.19□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 SYF2YGR129W 648 nt7.19□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 CUP1-1YHR053C 186 nt7.19□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 CUP1-2YHR055C 186 nt7.19□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YIL028WYIL028W 399 nt7.19□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 RPC25YKL144C 639 nt7.19□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 GTO3YMR251W 1101 nt7.19□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YBL062WYBL062W 381 nt7.19□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 SFG1YOR315W 1041 nt7.19□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 ARL3YPL051W 597 nt7.19□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YDR444WYDR444W 2064 nt7.19□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 ERG12YMR208W 1332 nt7.19□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 ASA1YPR085C 1332 nt7.19□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 EKI1YDR147W 1605 nt7.19□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 SES1YDR023W 1389 nt7.19□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 ENB1YOL158C 1821 nt7.18□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 RSM10YDR041W 612 nt7.18□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 CPR1YDR155C 489 nt7.18□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 RPL12AYEL054C 498 nt7.18□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YER137CYER137C 447 nt7.18□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.18□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 CDC73YLR418C 1182 nt7.18□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YMR245WYMR245W 621 nt7.18□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt7.18□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 TGS1YPL157W 948 nt7.18□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YPR142CYPR142C 564 nt7.18□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 SAD1YFR005C 1347 nt7.18□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 TMN2YDR107C 2019 nt7.18□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 STT3YGL022W 2157 nt7.18□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YKR018CYKR018C 2178 nt7.18□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YGR054WYGR054W 1929 nt7.17□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 KXD1YGL079W 657 nt7.17□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 PEX14YGL153W 1026 nt7.17□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 BUD32YGR262C 786 nt7.17□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 DOT5YIL010W 648 nt7.17□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YUH1YJR099W 711 nt7.17□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YBL094CYBL094C 333 nt7.17□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 IME4YGL192W 1803 nt7.16□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YDR015CYDR015C 240 nt7.16□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 SNF4YGL115W 969 nt7.16□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.16□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.16□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.16□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.16□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 NAT3YPR131C 588 nt7.16□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 MET3YJR010W 1536 nt7.16□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 SGE1YPR198W 1632 nt7.16□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 POB3YML069W 1659 nt7.16□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 HIS7YBR248C 1659 nt7.16□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YKR015CYKR015C 1707 nt7.15□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 BUD8YLR353W 1812 nt7.15□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 SSK1YLR006C 2139 nt7.15□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 RAP1YNL216W 2484 nt7.15□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 RRP8YDR083W 1179 nt7.15□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 ATP6Q0085 780 nt7.15□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YGL199CYGL199C 471 nt7.15□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 MTR3YGR158C 753 nt7.15□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 HOT13YKL084W 351 nt7.15□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 ICT1YLR099C 1185 nt7.15□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YLR112WYLR112W 420 nt7.15□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YLR156WYLR156W 345 nt7.15□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt7.15□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YLR159WYLR159W 345 nt7.15□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YLR161WYLR161W 345 nt7.15□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 SHP1YBL058W 1272 nt7.15□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.15□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 POP4YBR257W 840 nt7.15□□□□□ -1.26
SUB2Q07478 BDP1YNL039W 1785 nt7.15□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.5 ms