Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTDSPL2Q05D32 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CTDSPL2Q05D32 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms