Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms