Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Epha4Q03137 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 389.8 ms