Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SP3Q02447 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SP3Q02447 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SP3Q02447 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SP3Q02447 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SP3Q02447 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SP3Q02447 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SP3Q02447 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SP3Q02447 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SP3Q02447 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SP3Q02447 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SP3Q02447 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SP3Q02447 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SP3Q02447 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SP3Q02447 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SP3Q02447 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SP3Q02447 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SP3Q02447 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SP3Q02447 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SP3Q02447 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SP3Q02447 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SP3Q02447 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SP3Q02447 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SP3Q02447 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SP3Q02447 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SP3Q02447 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SP3Q02447 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SP3Q02447 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SP3Q02447 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SP3Q02447 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SP3Q02447 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SP3Q02447 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SP3Q02447 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SP3Q02447 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SP3Q02447 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP3Q02447 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP3Q02447 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP3Q02447 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP3Q02447 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP3Q02447 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP3Q02447 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP3Q02447 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP3Q02447 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP3Q02447 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP3Q02447 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP3Q02447 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP3Q02447 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SP3Q02447 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP3Q02447 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP3Q02447 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP3Q02447 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP3Q02447 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP3Q02447 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SP3Q02447 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP3Q02447 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP3Q02447 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP3Q02447 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP3Q02447 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP3Q02447 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP3Q02447 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP3Q02447 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SP3Q02447 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SP3Q02447 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SP3Q02447 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SP3Q02447 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SP3Q02447 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SP3Q02447 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SP3Q02447 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SP3Q02447 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SP3Q02447 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SP3Q02447 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SP3Q02447 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SP3Q02447 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP3Q02447 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP3Q02447 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP3Q02447 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP3Q02447 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP3Q02447 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP3Q02447 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP3Q02447 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP3Q02447 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SP3Q02447 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP3Q02447 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP3Q02447 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SP3Q02447 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SP3Q02447 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SP3Q02447 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SP3Q02447 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP3Q02447 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP3Q02447 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP3Q02447 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP3Q02447 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SP3Q02447 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP3Q02447 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP3Q02447 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP3Q02447 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP3Q02447 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SP3Q02447 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP3Q02447 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP3Q02447 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 646.7 ms