Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD1P98174 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD1P98174 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD1P98174 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD1P98174 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD1P98174 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD1P98174 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD1P98174 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD1P98174 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD1P98174 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD1P98174 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD1P98174 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD1P98174 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD1P98174 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD1P98174 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD1P98174 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD1P98174 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD1P98174 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD1P98174 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD1P98174 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD1P98174 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD1P98174 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD1P98174 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD1P98174 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD1P98174 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD1P98174 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD1P98174 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD1P98174 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD1P98174 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD1P98174 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD1P98174 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD1P98174 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD1P98174 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD1P98174 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FGD1P98174 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD1P98174 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD1P98174 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD1P98174 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD1P98174 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD1P98174 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD1P98174 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD1P98174 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD1P98174 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD1P98174 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD1P98174 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD1P98174 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD1P98174 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD1P98174 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD1P98174 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD1P98174 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD1P98174 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD1P98174 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD1P98174 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD1P98174 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD1P98174 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD1P98174 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD1P98174 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD1P98174 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD1P98174 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD1P98174 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD1P98174 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD1P98174 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD1P98174 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD1P98174 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD1P98174 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD1P98174 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD1P98174 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD1P98174 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD1P98174 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD1P98174 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD1P98174 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD1P98174 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD1P98174 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD1P98174 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FGD1P98174 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FGD1P98174 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FGD1P98174 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGD1P98174 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGD1P98174 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGD1P98174 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FGD1P98174 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGD1P98174 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGD1P98174 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD1P98174 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD1P98174 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD1P98174 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD1P98174 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD1P98174 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD1P98174 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD1P98174 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD1P98174 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD1P98174 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD1P98174 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD1P98174 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD1P98174 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD1P98174 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD1P98174 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD1P98174 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD1P98174 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD1P98174 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms